FA 制度引入的背景 - 从保留制度中解放
NPB 的自由球员制度于 1993 年引入。在此之前，NPB 球员受制于保留制度，即使合同到期也无权与其他球队自由谈判。该制度严重限制了球员的职业选择自由，球员工会长期以来一直寻求改善。1975 年 MLB 自由球员制度的确立为日本球员工会提供了重大推动力。然而，球团老板们强烈抵制制度引入，担心竞争平衡会崩溃。最终，FA 制度从 1993 年休赛期开始实施，但其条件与 MLB 相比极为严格。获得国内 FA 权需要 8 年的一军注册天数（后缩短为 7 年），国际 FA 权则设定了更长的期限。这种谨慎的制度设计旨在防止人才的剧烈流动。
历史性 FA 转会案例及其对棒球界的冲击
FA 制度引入后，众多重大转会震动了棒球界。1994 年休赛期落合博满从日本火腿转会至读卖，作为首个重大 FA 案例引起了广泛关注。然而，最具冲击力的是 2002 年松井秀喜从读卖转投 MLB。明星球员行使 FA 权流向海外的问题成为整个联盟的课题。在国内 FA 中，球员向读卖、阪神、软银等资金雄厚的球队集中受到批评。读卖尤其活跃于 FA 市场，被批评为「通过 FA 收购球员」。与此同时，FA 制度带来了球员薪资的膨胀，成为压迫球团经营的因素。宣布 FA 的球员即使选择留队，薪资也倾向于大幅上涨，制度本身的存在就具有增强球员谈判力的效果。
补偿制度与竞争平衡的探索
FA 制度包含对失去球员的球队的补偿制度。获得 FA 球员的球队有义务向原球队提供金钱补偿或未受保护的球员。该补偿制度一直作为维持竞争平衡的安全阀发挥作用。然而，围绕补偿内容的争论从未停止。批评包括金钱补偿金额与球员市场价值不匹配，以及保护名单人数限制不足等。2008 年补偿制度进行了修订，引入了对 FA 球员进行分级并相应区分补偿内容的机制。获得 A 级球员（前三分之一）需要丰厚的补偿，这实际上起到了抑制转会的效果。由于补偿过重，部分球员犹豫是否宣布 FA，部分球队放弃引进，制度原本「球员转会自由」的目的被批评为已经形同虚设。
FA 制度的现状与未来课题
现行 FA 制度在引入 30 多年后面临诸多课题。最大的争论点是获得 FA 权所需的年数之长。国内 FA 权需要 7 年、国际 FA 权需要 9 年的条件，与 MLB 的 6 年相比更长，导致球员在职业生涯巅峰期被束缚于一支球队。球员工会持续要求缩短资格年限，但球团方面因担忧人才流失而维持谨慎立场。市场活性化也是一个课题。近年来宣布 FA 的球员数量呈下降趋势，选择留队的情况增多。这被认为受到补偿制度的沉重负担以及球迷对 FA 转会的负面反应的影响。NPB 的 FA 制度在保护球员权利与维持竞争平衡这两个目标之间，今后仍将继续调整。